由于凝血酶具有切割序列專一性強，水解效率高的特點，它被廣泛地應用于基因工程產品的開發，其應用之一是作為工具蛋白酶用于重組融合蛋白質的特異性斷裂，尤其適用于生物工程制藥業及基因工程、生物化學、分子生物學等研究。

凝血酶是一種廣泛用于切割標簽的蛋白酶，能夠有效切質量比僅為1:2000的蛋白。建議消化緩沖液:20mMTris-HCl緩沖液，150mM NaCl，pH8.0，于20℃到37℃之間切割0.3到16小時,1U可切割約0.1-0.5mg蛋白。

凝血酶最佳切割位點是X4-X3-P-R[K]-X1'-X2',這里X4和X3是疏水氨基酸而X1'和X2'是非酸性氨基酸，一些經常使用的識別位點L-V-P-R-G-S,L-V-P-R-G-F,和M-Y-P-R-G-N。在X4-X3-P-R-G-X2'之間切割比在4-X3-P-K-L-X2'更有效。其他識別位點是X2-R[K]-X1',這里X2或者X1'是甘氨酸，例如A-R-G和G-K-A，這里切割發生在第二個殘基后。在凝血酶切割位點和N末端標簽之間插入五個甘氨酸殘基可改善切，通過這一"甘氨酸連接肽"只需較少酶量就可達到切割,而且也可以避免可能發生的錯誤切割。凝血酶可從切割產物中用p-氨基瓊脂糖親和純化,或者苯甲脒瓊脂糖移去。

牛凝血酶（Thrombin）

來源：牛血漿

性狀：白色或微黃色凍干粉

規格：1000U/支

保存：凍干粉4-8℃保存1年

純度：SDS-PAGE電泳純度≥95%（無蛋白酶）

比活：≥2000U/mgpr

使用方法：生理鹽水溶解使用，復溶后-20度凍存，避免反復凍融